Bảo tàng được chia thành 3 tầng có ý nghĩa tượng trưng, phía trái của bảo tàng đại diện cho quá khứ, sang phía phải là đại diện cho hiện tại và tương lai. Tầng trệt có công viên, vườn cây bản địa, thác nước, bể nước và một bộ sưu tập chùa chiền, bảo tháp, lồng đèn, văn bia (bao gồm bảo vật quốc gia số 2 của Hàn Quốc, chiếc chuông lớn Bosingak là mẫu mực của chuông Triều Tiên trong thời kỳ Joseon)

Tầng 1 là phòng trưng bày tiền sử và cổ đại, có chứa khoảng 4.500 tạo tác từ thời đồ đá cũ Paleolithic đến thời Tân La Silla thống nhất, được khai quật tại các khu vực ở bán đào Triều Tiên. Chín căn phòng ở đây bao gồm Phòng đồ đá cũ, Phòng thời kỳ đồ gốm Trất Văn, Phòng thời đồ đồng và Gojoseon (Triều Tiên cổ), Phòng thời đại tiền Tam Quốc Triều Tiên, Phòng Cao Câu Ly Goguryeo, Phòng Bách Tế Baekje, Phòng Già Da Gaya và phòng Tân La Silla. Các hiện vật bao gồm từ các rìu đá đến các vật trang sức hoàng gia xa hoa.

Các tạo tác từ những khu vực tiền sử và quân cư quan trọng như Bangudae Petroglyphs 반구대 암각화 và Songgung-ni 송국리 유적 được trưng bày ở phòng thời đồ gốm Trất Văn và đồ đồng.

Ở tầng 1 còn có phòng trưng bày Trung cổ và cận hiện đại, trưng bày các di sản văn hóa và lịch sử thời Tân La thống nhất Silla, Balhae, Goryeo, và Joseon (gồm 8 phòng).

Tầng 2 có phòng trưng bày các bộ sưu tập được quyên tặng và phòng trưng bày Thư pháp và hội họa.

Phòng thư pháp và hội họa có 890 hiện vật thể hiện nghệ thuật truyền thống và tôn giáo của Triểu Tiên. Phòng trưng bày Thư pháp và hội họa được chia thành 4 phòng: Hội họa, thư pháp, hội họa Phật giáo, và Sarangbang (사랑방).

Phòng trưng bày quyên tặng có 800 hiện vật nghệ thuật được các nhà sưu tập tư nhân tặng; được chia thành 11 phòng: Phòng sưu tập của Lee Hong-kun, Kim Chong-hak, Yu Kang-yul, Park Young-sook, Choi Young-do, Park Byong-rae, Yoo Chang-jong, Kaneko Kazushige, Hachiuma Tadasu, Iuchi Isao và Phòng sưu tập khác.

Tầng 3 có phòng trưng bày đồ điêu khắc và thủ công, với 630 hiện vật đại diện cho điêu khắc và thủ công Phật giáo Triều Tiên, nổi bật là các đồ gốm Goryeo và món quốc bảo số 83 Bangasayusang (Phật Di Lặc). 5 căn phòng ở đây gồm Phòng nghệ thuật kim khí, Phòng gốm, Phòng đồ Buncheong 분청사기, Phòng đồ sứ và phòng điêu khắc Phật giáo.

Ở tầng 3 còn có phòng trưng bày nghệ thuật châu Á, gồm 970 hiện vật thể hiện những sự tương đồng và đa dạng của nghệ thuật châu Á cũng như sự tương tác giữa nghệ thuật Á Âu thông qua con đường tơ lụa. 5 phòng ở đây bao gồm Phòng nghệ thuật Ấn Độ và Đông Nam Á, Phòng nghệ thuật Trung Á, Phòng nghệ thuật Trung Quốc, Phòng di tích Sinan 신안군, và phòng nghệ thuật Nhật Bản.